我所建于1972年，是以微生物在农业、轻工、食品、医药、环境保护等方面的应用研究和开发为主体的综合性独立科研机构，建所30年来，共取得高水平科技成果110项，成果转化百余项次，直接经济效益累计3200多万元，社会效益达50多亿元。
目前，我所已形成酶制剂、微生物肥料、生化制剂、食药用真菌、生物保鲜、食品酿造6个优势专业学科；完成了省级以上科研课题百余项，其中获奖成果三十多项，申请科技发明专利3项。由于我所在生物肥料研究与开发领域取得先进成果，国家科技部的委托河北省微生物所共承办了六届生物肥料国际培训班，共接待培训了30多个国家的160多名学员。到目前为止，我所分别与泰国清迈大学、印度旁泽普大学、以及俄罗斯科学院就生物肥料、食药用真菌、皮革工业用酶制剂等项目开展合作交流与技术合作，双方已多次派出专家组进行互访、考察和工我所共有五条生产线（生产车间），承担着科研成果的中间试验与转化任务。先后培育出十余种具备市场准入资格的生物技术产品。以成熟技术为依托，我所近来合作、合资组建了三个股份制公司。以硅酸盐菌剂技术（生物钾肥）为依托组建了“河北巨微生物工程有限公司”（我所占30%股份），总投资3158万元，生产规模年产一万吨硅酸盐菌剂，产值4960万元，可供2000万亩缺钾农田施用，社会效益6-8亿元，作为一家生物工程高科技企业，巨微分司一直受到国家、省有关部门的关注，被列入国家“火炬计划”和“国家重点工业性试验计划”项目，前省委书记叶连松先后三次到公司视察指导工作，目前该公司正在国家计委支持下，积极筹划向年产十万吨生物钾肥规模扩建。
我所以氧化酶技术为依托创办了“保定鲜尔康生物工程有限公司”（我所占34%股份）。鲜尔康公司主要从事新一代绿色功能性饲料添加剂，公司独家生产的“新型氧化酶”肠道保护剂——鲜尔康（Healthon），具有去氧、抑菌、防霉功能，使传统的以抗生素为主力的“药物预防程序”转变为以鲜尔康（Healthon）为主力的“肠道绿色保护程序”，符合我国“绿色高效”的养殖业发展方向，极具市场潜力，属朝阳产业，年产值400万元。为适应世界科技经济一体化发展，加快技术成果和产品的国际化步伐，我所早在1994年合资创办了“（中、德）保定施达科生物技术有限公司”现我所占股份（75%），主要从事食（药）用真菌产品的经营开发以及所内其它相关生物产品的国际市场开发与技术合作交流，年科工贸总收入60万元。
2001年，我所确定了以食品添加剂（葡萄糖氧化酶）、食药用真菌和生物复合肥为所内的主导产品，这些产品都有极大的市场潜力，我所经过设备调试等工作已经能够正常生产产品，现已全部取得卫生许可证和生产许可证。如果再有充足的市场运作资金，所的这三个主导产品将为微生物所产生更大的效益。
复合酶（饲料添加剂）的生产也是我所的重要产业，现每年可生产和销售40吨复合酶。